早孕反应的病因迄今未明，可能主要与体内激素作用机制和精神状态的平衡失调有关。而激素的作用系指在妊娠早期当妊娠呕吐最严重时，体内人绒毛膜促性腺激素（hCG）水平最高；双胎妊娠或水泡状胎块患者血内之hCG浓度明显增高，而发生剧吐者也显著增加，均提示本症与hCG的关系密切。

    此外，如肾上腺皮质功能低下则其皮质激素分泌不足，从而使体内水及糖类代谢紊乱，出现恶心呕吐等消化道症状，而且应用皮质激素治疗时，症状可明显改善，故亦认为肾上腺皮质功能降低也与妊娠剧吐有一定关系。有认为维生素B6缺乏也可能是发病的原因之一。

    无论如何，精神因素对妊娠剧吐的发生有着较大的关系。特别是孕妇对妊娠本身有恐惧心理或有厌烦，以及受到民间封建迷信思想影响等均可致呕吐加剧。有严重痛经史者，发生妊娠剧吐的几率增大。